発酵マット使用中にケース側面に水滴と線虫がみられました。このマットは使用できますか？

マットを完全に乾燥させてしまえば線虫はどこかへいってしまいます。また加水し、湿度が高いならばまた戻ってくる可能性は高いので、ケース内の湿度は多からず少なからずの頃合が良いと思います。マットは乾燥させてもまた使用できるので大丈夫だと思います。